師資
基本概況
黃捷,副教授、研究員、博士生導(dǎo)師、公共衛(wèi)生及應(yīng)急管理學(xué)院應(yīng)急管理研究中心執(zhí)行主任、華大基因?qū)W院榮譽(yù)教授、北京大學(xué)全球健康發(fā)展研究院兼職研究員。先后就讀于北京大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院(本科)、北京體育大學(xué)研究生院(碩士)、密西根大學(xué)信息學(xué)院(碩士)、北卡羅萊納大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院(碩士)、劍橋大學(xué)(博士)。 曾任哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院講師、美國退伍軍人事務(wù)部波士頓榮軍醫(yī)院資深科學(xué)家。在國際著名學(xué)術(shù)期刊發(fā)表文章70余篇,其中包括在《自然》、《自然通訊》、《血液》、《核酸研究》、《生物信息》等國際一流雜志上發(fā)表的第一作者文章。個(gè)人著作《基因的名義》一書于2018年由《高等教育出版社》出版,同年入選“中華優(yōu)秀科普?qǐng)D書榜”。個(gè)人著作《核酸大爆炸》一書于2022年由《北京大學(xué)出版社》出版。
研究方向
全球衛(wèi)生大數(shù)據(jù)研究:針對(duì)全球大流行性傳染?。òㄐ鹿诓《痉窝祝┑囊咔榇髷?shù)據(jù)研究,基于傳染病傳播動(dòng)力學(xué)模型的預(yù)測和決策研究,基于病原微生物全基因組的系統(tǒng)發(fā)生樹(phylogeny)方法學(xué)研究,基于機(jī)器學(xué)習(xí)的病毒三維結(jié)構(gòu)預(yù)測研究。
慢性病決定因素研究:基于大隊(duì)列(包括英國 UK Biobank)的系統(tǒng)生物學(xué)研究;聚焦心血管疾病、肥胖、老年癡呆癥等全球公共衛(wèi)生重點(diǎn)關(guān)注的慢性疾病的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)研究、基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究(Polygenic Risk Score)。
個(gè)人基因組學(xué)研究:個(gè)人全基因組測序數(shù)據(jù)深度挖掘,包括對(duì)自閉癥和地中海貧血等疾病的生物信息學(xué)分析流程和方法創(chuàng)新。
教育經(jīng)歷
2012年 1月 - 2015年7月, 英國劍橋大學(xué)生物科學(xué)博士
2005年8月 - 2006年8月, 美國北卡大學(xué)衛(wèi)生管理學(xué)碩士
1999年9月 - 2002年4月,美國密西根大學(xué)信息科學(xué)碩士
1996年9月 – 1999年6月,北京體育大學(xué)教育學(xué)碩士
1991年9月 – 1996年6月,北京醫(yī)科大學(xué)預(yù)防醫(yī)學(xué)學(xué)士
工作經(jīng)歷
2022年3月–至今 南方科技大學(xué)公共衛(wèi)生與應(yīng)急管理學(xué)院,副教授、研究員、博士生導(dǎo)師、應(yīng)急管理研究中心執(zhí)行主任
2018年6月–2022年2月,北京大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院全球衛(wèi)生學(xué)系研究員、博士生導(dǎo)師
2015年6月–2018年4月,美國退伍軍人醫(yī)院波士頓榮軍醫(yī)院資深科學(xué)家
2012年1月–2014年8月,英國桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)資深生物信息分析師
2009年10月–2012年1月,美國國立衛(wèi)生研究院Framingham Heart Study博士后
2007年9月–2009年9月,哈佛大學(xué)麻省總醫(yī)院人類基因研究中心博士后
2006年8月 - 2007年8月,美國西北大學(xué)醫(yī)學(xué)院神經(jīng)疾病研究所資深生物信息分析師,
2003年8月– 2005年7月,杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院放射影像中心計(jì)算機(jī)程序員III
科研項(xiàng)目
中國疾病預(yù)防控制中心(CDC),“新冠疫情防控策略調(diào)整模型研究方案”。
科技部重大專項(xiàng),“多學(xué)科視角新冠病毒溯源研究”。
國家自然科學(xué)基金委員會(huì)面上項(xiàng)目,“基于大數(shù)據(jù)建模的新冠病毒肺炎疫苗接種策略與政策研究”。
科技部主動(dòng)健康和老齡化科技應(yīng)對(duì)重大專項(xiàng),“營養(yǎng)、運(yùn)動(dòng)對(duì)老年健康的影響和干預(yù)作用”。
深圳市科創(chuàng)委重大專項(xiàng),“新冠病毒新變異株疫情深圳防控策略研究”。
深圳市醫(yī)療衛(wèi)生三名工程高層次醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目,“急救醫(yī)療體系及醫(yī)療優(yōu)先分級(jí)調(diào)度系統(tǒng)建設(shè)項(xiàng)目”。
深圳市醫(yī)療衛(wèi)生三名工程高層次醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目,“深圳市自閉癥中心”。
中國外文局當(dāng)代中國與世界研究院,“人類衛(wèi)生健康共同體的國際傳播研究”。
北京大學(xué)雙一流建設(shè),“全球衛(wèi)生研究院全球衛(wèi)生大數(shù)據(jù)中心平臺(tái)建設(shè)”。
代表性論文(#共同一作,*通訊作者)
Huang J*, McLean GR, Dubee FC, Zheng ZJ, Two Pandemics in China, One Health in Chinese. BMJ Global Health. 2022. April.
Wang M, Wang S, Peng H, Huang J*, Wu T*, Qi L. Arterial stiffness, genetic risk, and type 2 diabetes: a prospective cohort study. Diabetes Care. 2022 April.
Huang J#, Liu J#, Ruiyi Tian, Na Zhang, Hannah Sherman, Patrick Zhuang, Christoph Budjan, Kevin Liu, Michelle Fong, Cullen Clairmont, Minseo Jang, Xue-Jun Kong. A Next Generation Sequencing-Based Protocol for Screening of Variants of Concern in Autism Spectrum Disorder. Cells. 2022
Huang J*, Zhi-Sheng Liang, Stefano Pallotti, Daniel A. King, Zhi-Jie Zheng, Qiang Zhou, Houfeng Zheng, Francesco M. Carpi, Valerio Napolioni*. PAGEANT: Personal access to genome & analysis of natural traits. Nucleic Acids Research. 2021 Dec 20;gkab1245
Huang J*, Pallotti S, Zhou Q, Kleber M, Xin X, King DA, Napolioni V*. PERHAPS: Paired-End short Reads-based HAPlotyping from next-generation Sequencing data. Briefings in Bioinformatics. 2020 Dec 8;bbaa320
Walter K#, Min JL#, Huang J#, Crooks L#. The UK10K project identifies rare variants in health and disease. Nature. 2015 Oct 1;526(7571):82-90.
Huang J#, Howie B, McCarthy S, Memari Y, Walter K, Min JL, Danecek P, Malerba G, Trabetti E, Zheng HF; UK10K Consortium., Gambaro G, Richards JB, Durbin R, Timpson NJ, Marchini J, Soranzo N. Improved imputation of low-frequency and rare variants using the UK10K haplotype reference panel. Nature Communications. 2015 Sep 14;6:8111
Huang J#,. Genome-wide association study for circulating levels of PAI-1 provides novel insights into its regulation. Blood. 2012 Dec 6;120(24):4873-81.
Huang J#, Johnson AD, O'Donnell CJ. PRIMe: a method for characterization and evaluation of pleiotropic regions from multiple genome-wide association studies. Bioinformatics. 2011 May 1;27(9):1201-6.
Huang J#, Perlis RH, Lee PH, Rush AJ, Fava M, Sachs GS, Lieberman J, Hamilton SP, Sullivan P, Sklar P, Purcell S, Smoller JW. Cross-disorder genomewide analysis of schizophrenia, bipolar disorder, and depression. American Journal of Psychiatry. 2010 Oct;167(10):1254-63.